按照微软的定义，系统启动文件所在的分区(BCD Bootmgr)叫系统分区；windows文件夹所在的分区叫引导分区。

根据现有的信息判断，系统分区启动文件在机械硬盘上。C:\windows在固态上。

 系统分区和引导分区不在同一个存储上，任意一个存储出问题都会导致系统无法启动。

已经有C:\windows的固态，分区已经设置好，很难在上面调整建立系统分区和引导文件。

办法不是没有，比较复杂。将固态的C:\分区用软件备份，拔掉HDD然后在固态上装一次系统或者用命令建立系统分区和启动文件，然后将备份的C分区还原到固态。不拔掉HDD，装系统或者操作不当，还是只会处理HDD上的系统分区而不是在固态上新建系统分区。

还是装一次系统比较简单。